Ansamblul Bisericii „Sfânta Treime” s-a dezvoltat odată cu târgul Botoşani. Lăcaşul de cult a fost ridicat din piatră, în anul 1795, pe locul a două biserici din lemn, una din anul 1655, cu acelaşi hram şi una din anul 1560, cu hramul Sf. Oxente (Axente). Din 1991, an în care turla mare a bisericii s-a prăbuşit în interior, Ansamblul Sf. Treime se află în conservare. !Dar acum, Biserica armeană „Sfânta Treime” va trece printr-un amplu proces de consolidare. Proiectul, iniţiat de Parohia Bisericii Armene din Botoşani, este abia la început, în această perioadă realizându-se documentaţia tehnico-economică. Costurile acesteia au o valoare de 340.000 de lei şi sunt suportate de Ministerul Culturii şi Cultelor. De altfel, în perioada 2000-2014, guvernul României a reabilitat cealaltă biserică armeană din oraş, „Sfânta Maria”. Pe 15 August 2004 a fost sfinţit paraclisul, apoi lucrările au continuat în interior până în 2014 când, la 665 de ani de la zidirea bisericii, aceasta fost resfinţită.
